Curriculum Vitae
Expérience professionnelle
| Depuis Septembre 2017 | Maître de conférences — Université de BordeauxLaboratoire ARNA, INSERM U1212, CNRS UMR5320, équipes BALI puis Prism
UFR Sciences pharmaceutiques, Collège santé, Université de Bordeaux Enseignant en sciences analytiques et sur les aspects réglementaires de l’analyse physico chimique dans l’industrie pharmaceutique. |
| Août 2017 — Avril 2015 | R&D Scientist II — Quality Assistance — Donstiennes (Belgique)
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| Mars 2015 — Octobre 2013 | Postdoctorant — INSERM U869 — BordeauxLaboratoire ARNA, équipes Mergny et Gabelica
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| Septembre 2013 — Septembre 2012 | Postdoctorant — University of British Columbia — Vancouver Canada)Perrin Lab , Chemistry department
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| Juillet 2012 — Janvier 2012 | Postdoctorant — CNRS UMR 176 — Institut Curie — OrsayEquipe Teulade-Fichou
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| Décembre 2011 — Octobre 2008 | Doctorant — CNRS UMR 176 — Institut Curie — Université Paris XI — OrsayEquipe Teulade-Fichou
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| Juillet 2010 — Octobre 2008 | Vacataire — Université Paris XI — OrsayIUT, Département mesures physiques
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Éducation
| 2011 — 2008 | Doctorat de chimie — Université Paris XI — OrsayCiblage d’acides nucléiques G quadruplexes : Synthèse et développement de méthodes pour l’analyse et le criblage de ligands sélectifs multimodaux (30/11/2011) Bourse de Docteur Ingénieur (CNRS/Institut Curie) |
| 2008 — 2006 | Master de recherché en chimie fine, analytique et polymères —Université de Cergy Pontoisemention très bien |
| 2008 — 2003 | Diplôme d’ingénieur chimiste Ecole Supérieure de Chimie Organique et Minérale |
Compétences
Mesures physiques et biophysiques
Spectrométrie de masse (IMS MS, Q TOF, MALDI TOF, ion trap), échange hydrogène deutérium (HDX) couplé à la spectrométrie de masse native , U(H)PLC, 2D UPLC, spectroscopies UV-vis, fluorescence et dichroïsme circulaire, méthodes haut débit et automatisation
Méthodes biochimiques
Purification/analyse d’oligonucléotides par PAGE, PCR, purification sur billes magnétiques, fragmentation/digestion/dérivatisation de protéines et glycanes
Chimie médicinale
Synthèses organique et inorganique, criblage haut débit
Chimie computationnelle et chémoinformatique
DFT, dynamique moléculaire, criblage virtuel, clustering, analyse en composantes principales , décomposition en valeurs singulières
Langage de programmation
R (traitement de données, visualisations, bases de données, documents interactifs et web), Python, HTML, CSS, Markdown
Langues
Français (natif), Anglais (C2), Portugais (Brésil ; B1), Espagnol (B2), Néerlandais (A2)
Financements / Récompenses
RIPEC C3 depuis 2023
Financement ANR JCJC (240 k€): DNA-HDXMS : Hydrogen deuterium exchange mass spectrometry of nucleic acids, coordinateur, 2021 — 2025
Financement projet ESR (porté par V. Gabelica, contribution de 10%), région Nouvelle Aquitaine / Merck : Caractériser le repliement de protéines thérapeutiques recombinantes par spectrométrie de masse couplée à la spectrométrie de mobilité ionique, 2019 — 2021
Financement MAPI (projet STEP) pour le soutien à la transformation et à l’expérimentation pédagogiques (porté par K. Gaudin) : Modernisation de l’UE « Sciences Analytiques » en 2ème année des études de pharmacie , 2018 — 2020
Bourse postdoctorale Banting (140 k$) : Discovery and development of protein like DNAzymes that cleave target RNA with high efficiency, 2012 — 2013
Bourse de Docteur Ingénieur (co financement CNRS / Institut Curie), 2008 — 2011
Novartis funding for master degree internships in schools of the Federation Gay Lussac, 2008
Directions et encadrement d’étudiants
Postoctorante
Dr. Nina Khristenko : co-encadrement, 2019 — 2021 | Cf. HDX/MS native de protéines thérapeutiques
- Financement projet ESR, région Nouvelle Aquitaine / Merck.
- Expertise en HDX/MS et développement de méthodes analytiques : conception et réalisation des expériences, traitement de données, interprétation des résultats et rédaction du manuscrit [1]
Doctorant(e)s
Matthieu Ranz : direction (ADT 100%), thèse soutenue (U. Bordeaux, 2024) | Cf. Sections Application à la biophysique des G4s, Couplage à la mobilité ionique, Etude de complexes G4/petites molécules, Spectrométrie de masse native d’acides nucléiques
- Financement projet ANR
- Direction administrative et scientifique. Expertise en HDX/MS, développement de méthodes analytiques et développement logiciel, biophysique d’acides nucléiques : direction doctorale formelle, conception et réalisation des expériences, traitement de données, interprétation des résultats et rédaction de manuscrits [2–4]
\(\mapsto\) Actuellement : Postdoctorant (ARNA)
Alexander König : co-encadrement, thèse soutenue (U. Bordeaux, 2023) | Cf. Ligands foldamères spécifiques des topologies parallèles
- Financement école doctorale
- Encadrement scientifique. Expertise en spectrométrie de masse native, biophysique d’acides nucléiques et de leurs ligands : conception et réalisation des expériences, traitement de données, interprétation des résultats et rédaction de manuscrits (deux manuscrits en cours de rédaction) [5]
\(\mapsto\) Actuellement : Project scientist (dsm-firmenich)
Silvia Ceschi : co-encadrement (6 mois, 2019) Thèse soutenue (U. Padoue, Italie) | Cf. Ligands pérylènes spécifiques d’une conformation intermédiaire de structuration de c-KIT2
- Encadrement scientifique. Expertise en spectrométrie de masse native, biophysique d’acides nucléiques et de leurs ligands : conception et réalisation des expériences, traitement de données, interprétation des résultats et rédaction du manuscrit [6]
Master 2 et équivalents
Clarisse Fourel : encadrement stage fin d’étude (01 au 08/2023 , ENSMAC, Pessac) | Cf. Etude de complexes G4/petites molécules
- Financement sur fonds propres
- Encadrement administratif et scientifique Expertise en HDX/MS et développement de méthodes analytiques : conception et réalisation des expériences, traitement de données, interprétation des résultats.
\(\mapsto\) Actuellement : Doctorat en biologie structurale (ICSN, Université Paris Saclay)
Cristina Dal Lago : Encadrement M2 soutenu ( 2022 , U. Padoue, Italie) | Cf. Ligands avec des activités anticancéreuses ou antiparasitaires
- Financement Erasmus+
- Encadrement administratif et scientifique. Expertise en spectrométrie de masse native, biophysique d’acides nucléiques et de leurs ligands : conception et réalisation des expériences, traitement de données, interprétation des résultats et rédaction du manuscrit [7]
\(\mapsto\) Actuellement : Stagiaire en développement analytique (Aptuit, Italie)
Wenbo Liu : co-encadrement M2 soutenu (2012-2013, UBC, Canada) | Cf. Synthèse, caractérisation et optimisation d’oligonucléotides incorporants des nucléotides bifaciaux
- Encadrement scientifique. Expertise en biophysique des acides nucléiques, DFT et dynamique moléculaire : conception et réalisation des expériences, traitement de données, interprétation des résultats et rédaction de manuscrits [8, 9]
\(\mapsto\) Actuellement : Professeur (Université Sun Yat-sen, Chine)
Abid Hasan : co-encadrement M2 soutenu (2012-2013, UBC, Canada) | Cf. Synthèse, caractérisation et optimisation d’oligonucléotides incorporants des nucléotides bifaciaux
- Encadrement scientifique. Expertise en biophysique des acides nucléiques, DFT et dynamique moléculaire : conception et réalisation des expériences, traitement de données, interprétation des résultats et rédaction de manuscrits [9, 10]
\(\mapsto\) Actuellement : Software engineer (Jobber Inc., Canada)
Emile Feugas, Mathilde Melot, Antoine Quaresima, Eve Descomps, Jade Juin, Alexis Darmaillacq : Gestion de projets (6 semaines, U. Bordeaux , 2019-2024) | Cf. Ligands avec des activités anticancéreuses ou antiparasitaires
- Encadrement administratif et scientifique. Expertise en spectrométrie de masse native, biophysique d’acides nucléiques et de leurs ligands : conception et réalisation des expériences, traitement de données, interprétation des résultats
\(\mapsto\) Actuellement : Consultant contrôle qualité (Nalys, Belgique)
Master 1 et équivalents
- Laura Fricot (2018, Université de Bordeaux) | Cf. Preuve de concept | \(\mapsto\) Ingénieure R&D synthèse (Oleon, France)
- Matthieu Ranz (2020, ENSMAC) | Cf. Ligands avec des activités anticancéreuses ou antiparasitaires | \(\mapsto\) Postdoctorant (ARNA)
- Romane Guisiano (2022, ENSIACET) | Cf. Couplage à la mobilité ionique \(\mapsto\) Doctorat en pharmacie (Institut Cochin, Université Paris Cité)
- Avant 2017
- Katie Mingo (MIT, Boston, USA , Cf. Instabilité génomique de minisatellites humains déclenchée par des ligands de G4, [11]) | \(\mapsto\) oto-rhino-laryngologue (Cleveland Clinic, USA)
- Marie Perrot (ESCOM , Cf. Exploration d’une chimiothèque) | \(\mapsto\) chargée de projet (Azur Drones, France)
- Reuben Ovadia U. Montpellier , Cf. Ligands fonctionnalisés pour la sélection d’aptamères anti-G4) | \(\mapsto\) European Patent Attorney (Servier, France)
- Julien Botton U. Paris VI , Cf. Effets de ligands de G4 halogénés sur la séquence terminale des télomères humains) | \(\mapsto\) Delivery Owner (La Poste Groupe, France)
- Valentine Boyer (EBI , Cf. Exploration d’une chimiothèque) | \(\mapsto\) Marketing manager (Perrigo, France)
IUT/BTS/DEUST/Licence
- Depuis 2017 :
- Anaïs Ferrer | \(\mapsto\) Consultante qualification (Altogen, France)
- Matthieu Vida
- Benjamin Lienard | \(\mapsto\) Ingénieur technico-commercial (Opheleia instruments, France)
- Axel Florent | \(\mapsto\) Master 2 (Bordeaux, France)
- Mathieu Bonnardel
- Yann Bourdeau | \(\mapsto\) Doctorat en chimie, (Université de Bordeaux)
- Avant 2017 :
Marie Toulisse | \(\mapsto\) Responsable cellule approvisionnement (SNCF, France)
Margaux Legrand | \(\mapsto\) Research assistant (NovImmune, France)
Camille Valette | \(\mapsto\) Technicienne de développement technologique (MANE, France)
Yoann Lebreton
Responsabilités recherche et activités annexes
- Référent Science Ouverte d’ARNA
- Référent Données de la recherche d’ARNA
- Membre de l’Atelier Bordelais des Données de recherche (ABDo)
- Membre du groupe de travail Éthique, intégrité, genre et science ouverte pour l’obtention du label HRS4R (Stratégie Européenne des Ressources Humaines pour les Chercheurs)
- Membre de l’équipe communication du laboratoire ARNA (activités de vulgarisation, communication du laboratoire, conception de logos et couvertures). Portfolio : https://ericlarg4.github.io/Portfolio/
- Consultance dans l’industrie pharmaceutique pour des problématiques d’HDX/MS de protéines thérapeutiques, et de caractérisation de structures d’oligonucléotides thérapeutiques
- Expert auprès de la Commission Européenne pour l’évaluation de financements EIC PathFinder et bourses postdoctorales Marie Skłodowska-Curie
- Reviewer pour Advanced Science, Analytical Chemistry, Journal of Chromatography A, Journal of Medicinal Chemistry, Nucleic Acids Research, Physical Chemistry Chemical Physics, The Journal of Physical Chemistry,…
Responsabilités et activités d’enseignement
UFR des sciences pharmaceutiques
Enseignant dans les formations suivantes :
Docteur en pharmacie (2ème et 3ème années du Diplôme de Formation Générale en Sciences Pharmaceutiques) : sciences analytiques (chimie des solutions, spectroscopies, chromatographies)
DEUST Production, contrôle et qualité des produits de santé Chimie analytique (1ère et 2ème années) : chimie des solutions, spectroscopies, chromatographies, aspects réglementaires du contrôle qualité
Licence TECSAN : spectrométrie de masse et chimie des solutions
Master 1 IPPS : chimie des solutions
Masters 2 AC2QMAPS (Analyse chimique, contrôle qualité du médicament et autres produits de santé) et ACDNP (analytical chemistry for drugs and natural products) jusqu’en 2023 puis DACQ : Contrôle qualité du médicament, développement analytique en chromatographie, transferts de méthodes analytiques, détecteurs, qualification instrumentale, analyse de biomolécules, communication.
Responsable des travaux pratiques de sciences analytiques (DFGSP2, ~ 160 étudiants, 63 séances / an)
Membre du jury de délibération en deuxième année de pharmacie
Responsable d’UEs du M2 AC2QMAPS puis DACQ : Qualification , Recherche et développement analytique , Contrôle qualité appliqué au produit fini, Analyse de biomolécules
Responsable de l’UE Research & development in analytical chemistry du M2 ACDNP
Responsable des UEs Chimie analytique et Réglementaire du DEUST Production, contrôle et qualité des produits de santé
Conception et implémentation du logiciel de travaux pratiques virtuels SANTools [12]
Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux
- Enseignant pour le diplôme de préparateur en pharmacie hospitalière : sciences analytiques (chimie des solutions, spectroscopies, chromatographies)
Collège des Écoles Doctorales de l’Université de Bordeaux
Enseignant auprès des doctorants de l’Université de Bordeaux (débutera en 2026) :
Concevoir une présentation axée recherche / innovation
Concevoir un poster : bonnes pratiques pour communiquer visuellement des données scientifiques
Design a poster: best practices for communicating scientific data visually
Communiquer visuellement vos données scientifiques avec R : conception de figures scientifiques
Publications
2163 citations, h-index 22.1
1 Valeurs calculées automatiquement à partir des données de Google Scholar, avec le package scholar[13].
Les étudiants et postdoctorants supervisés apparaissent en orange et le candidat en bleu.
Articles académiques
Sigl, J.; Morozov, V.; Wang, L.; Sachs, J.; Merlet, E.; Largy, E.;, Kwon, S.; Sanchez, F.; Candela, L.; Huet, S.; Ferrand, Y.; Douat, C.; Mackereth, C.D.; Huc, Y. An artificial protein-foldamer supramolecular synthon for self-assembled hybrid architectures. Science, soumis
Kabbara, A.; Buré, C.; Guedin, A.; Kauffmann, B.; Largy, E.; Marquevielle, J.; Bonnafous, P.; Mdarhri, Z.; Ferrand, Y.; Gabelica, V.; Rosu, F.; Andreola, M.-L.; Olivier, C.; Amrane, S. Dibenzoacridinium derivatives as a new class of G-Quadruplex ligands with anti-HIV-1 properties. NAR Mol. Med., soumis
König, A.; Laffilé, V.; Thore, S.; Mackereth, C. D.; Yatsunyk, L.; Ferrand, Y.; Largy, E.;* Gabelica, V.* Helical aromatic oligoamide foldamers as selective G-quadruplex ligands. Nucleic Acids Res., 2025, accepted. bioRxiv: 2025.02.25.640101. https://doi.org/10.1101/2025.02.25.640101.
Tsalmpouris, A., Largy, E.; Guillarme, D.* Systematic evaluation of phenyl stationary phases for oligonucleotide analysis without ion-pairing reagents. J. Chrom. A, 2025, 1762, 466395. https://doi.org/10.1093/nar/gkaf953.
Largy, E.;* Guedin, A., Kabbara, A.; Mergny, J.-L.*, Amrane, S.* Eps2Fold: A Rapid method to characterize G-quadruplex DNA structures using single absorbance spectra. Nucleic Acids Res., 2025, 53 (18), gkaf953. https://doi.org/10.1093/nar/gkaf953.
Kretsch, R. C.; Albrecht, R.; Andersen, E. S.; Chen, H.; Chiu, W.; Das, R.; Gezelle, J. G.; Hartmann, M. D.; Höbartner, C.; Hu, Y.; Jadhav, S.; Johnson, P. E.; Jones, C. P.; Koirala, D.; Kristoffersen, E. L.; Largy, E.; Lewicka, A.; Mackereth, C. D.; Marcia, M.; Nigro, M.; Ojha, M.; Piccirilli, J. A.; Rice, P. A.; Shin, H.; Steckelberg, A.; Su, Z.; Srivastava, Y.; Wang, L.; Wu, Y.; Xie, J.; Zwergius, N. H.; Moult, J.; Kryshtafovych, A. Functional Relevance of CASP16 Nucleic Acid Predictions as Evaluated by Structure Providers. Proteins 2025, prot.70043. https://doi.org/10.1002/prot.70043.
Guillon, J.; Le Borgne, M.; Milano, V.; Guédin-Beaurepaire, A.; Moreau, S.; Pinaud, N.; Ronga, L.; Savrimoutou, S.; Albenque-Rubio, S.; Marchivie, M.; Kalout, H.; Walker, C.; Chevallier, L.; Buré, C.; Largy, E.; Gabelica, V.; Mergny, J.-L.; Baylot, V.; Ferrer, J.; Idrissi, Y.; Chevret, E.; Cappellen, D.; Desplat, V.; Schelz, Z.; Zupkó, I. New 2,4-Bis[(Substituted-Aminomethyl)Phenyl]Phenylquinazoline and 2,4-Bis[(Substituted-Aminomethyl)Phenyl]Phenylquinoline Derivatives: Synthesis and Biological Evaluation as Novel Anticancer Agents by Targeting G-Quadruplex. Pharmaceuticals 2024, 17 (1), 30. https://doi.org/10.3390/ph17010030.
Largy, E.;* Ranz, M.; Gabelica, V. A General Framework to Interpret Hydrogen–Deuterium Exchange Native Mass Spectrometry of G-Quadruplex DNA. J. Am. Chem. Soc. 2023, jacs.3c09365. https://doi.org/10.1021/jacs.3c09365.
Largy, E.;* Ranz, M. OligoR: A Native HDX/MS Data Processing Application Dedicated to Oligonucleotides. Anal. Chem. 2023, acs.analchem.3c01321. https://doi.org/10.1021/acs.analchem.3c01321.
Khristenko, N.; Rosu, F.; Largy, E.; Haustant, J.; Mesmin, C.; Gabelica, V. Native Electrospray Ionization of Multi-Domain Proteins via a Bead Ejection Mechanism. J. Am. Chem. Soc. 2023, 145 (1), 498–506. https://doi.org/10.1021/jacs.2c10762.
Largy, E.; Alies, B.; Condesse, G.; Gaubert, A.; Livingston, T.; Gaudin, K. Teaching with Simulation Tools to Introduce the Basics of Analytical Chemistry Instrumentation. Anal Bioanal Chem 2022, 414, 6709–6721. https://doi.org/10.1007/s00216-022-04268-0.
Guillon, J.; Cohen, A.; Boudot, C.; Monic, S.; Savrimoutou, S.; Moreau, S.; Albenque-Rubio, S.; Lafon-Schmaltz, C.; Dassonville-Klimpt, A.; Mergny, J.-L.; Ronga, L.; Bernabeu de Maria, M.; Lamarche, J.; Dal Lago, C.; Largy, E.; Gabelica, V.; Moukha, S.; Dozolme, P.; Agnamey, P.; Azas, N.; Mullié, C.; Courtioux, B.; Sonnet, P. Design, Synthesis, and Antiprotozoal Evaluation of New Promising 2,9-Bis[(Substituted-Aminomethyl)]-4,7-Phenyl-1,10-Phenanthroline Derivatives, a Potential Alternative Scaffold to Drug Efflux. Pathogens 2022, 11 (11), 1339. https://doi.org/10.3390/pathogens11111339.
Largy, E.; König, A.; Ghosh, A.; Ghosh, D.; Benabou, S.; Rosu, F.; Gabelica, V. Mass Spectrometry of Nucleic Acid Noncovalent Complexes. Chem. Rev. 2021, 122, 7720–7839. https://doi.org/10.1021/acs.chemrev.1c00386.
Ghosh, A.; Largy, E.;* Gabelica, V*. DNA G-Quadruplexes for Native Mass Spectrometry in Potassium: A Database of Validated Structures in Electrospray-Compatible Conditions. Nucleic Acids Res 2021, 49 (4), 2333–2345. https://doi.org/10.1093/nar/gkab039.
Guillon, J.; Denevault‐Sabourin, C.; Chevret, E.; Brachet‐Botineau, M.; Milano, V.; Guédin‐Beaurepaire, A.; Moreau, S.; Ronga, L.; Savrimoutou, S.; Rubio, S.; Ferrer, J.; Lamarche, J.; Mergny, J.; Viaud‐Massuard, M.; Ranz, M.; Largy, E.; Gabelica, V.; Rosu, F.; Gouilleux, F.; Desplat, V. Design, Synthesis, and Antiproliferative Effect of 2,9‐bis[4‐(Pyridinylalkylaminomethyl)Phenyl]‐1,10‐phenanthroline Derivatives on Human Leukemic Cells by Targeting G‐quadruplex. Archiv der Pharmazie 2021, 354 (8), 2000450. https://doi.org/10.1002/ardp.202000450.
Butré, C. I.; Largy, E.; Delobel, A. Profiling of N-Linked Oligosaccharides of a Glycoprotein by UPLC-FLR-ESI-MS After Derivatization with Fluorescent Anthranilamide. Methods Mol Biol 2021, 2271, 179–188. https://doi.org/10.1007/978-1-0716-1241-5_13.
Butré, C. I.; Largy, E.; Cantais, F.; Delobel, A. Profiling, Relative Quantification, and Identification of Sialylated N-Linked Oligosaccharides by UPLC-FLR-ESI/MS After Derivatization with Fluorescent Anthranilamide. Methods Mol Biol 2021, 2271, 237–247. https://doi.org/10.1007/978-1-0716-1241-5_17.
Miranda, A.; Santos, T.; Largy, E.; Cruz, C. Locking up the AS1411 Aptamer with a Flanking Duplex: Towards an Improved Nucleolin-Targeting. Pharmaceuticals 2021, 14 (2), 121. https://doi.org/10.3390/ph14020121.
Ceschi, S.; Largy, E.; Gabelica, V.; Sissi, C. A Two-Quartet G-Quadruplex Topology of Human KIT2 Is Conformationally Selected by a Perylene Derivative. Biochimie 2020, 179, 77–84. https://doi.org/10.1016/j.biochi.2020.09.015.
Largy, E.;* Gabelica, V. Native Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry of Structured DNA Oligonucleotides. Anal. Chem. 2020, 92 (6), 4402–4410. https://doi.org/10.1021/acs.analchem.9b05298.
Renders, M.; Dumbre, S.; Abramov, M.; Kestemont, D.; Margamuljana, L.; Largy, E.; Cozens, C.; Vandenameele, J.; Pinheiro, V. B.; Toye, D.; Frère, J.-M.; Herdewijn, P. Kinetic Analysis of N -Alkylaryl Carboxamide Hexitol Nucleotides as Substrates for Evolved Polymerases. Nucleic Acids Research 2019, 47 (5), 2160–2168. https://doi.org/10.1093/nar/gkz008.
Belarif, L.; Mary, C.; Jacquemont, L.; Mai, H. L.; Danger, R.; Hervouet, J.; Minault, D.; Thepenier, V.; Nerrière-Daguin, V.; Nguyen, E.; Pengam, S.; Largy, E.; Delobel, A.; Martinet, B.; Le Bas-Bernardet, S.; Brouard, S.; Soulillou, J.-P.; Degauque, N.; Blancho, G.; Vanhove, B.; Poirier, N. IL-7 Receptor Blockade Blunts Antigen-Specific Memory T Cell Responses and Chronic Inflammation in Primates. Nat Commun 2018, 9 (1), 4483. https://doi.org/10.1038/s41467-018-06804-y.
Zhou, J.; Amrane, S.; Rosu, F.; Salgado, G. F.; Bian, Y.; Tateishi-Karimata, H.; Largy, E.; Korkut, D. N.; Bourdoncle, A.; Miyoshi, D.; Zhang, J.; Ju, H.; Wang, W.; Sugimoto, N.; Gabelica, V.; Mergny, J.-L. L. Unexpected Position-Dependent Effects of Ribose g-Quartets in g-Quadruplexes. Journal of the American Chemical Society 2017, 139 (23), 7768–7779. https://doi.org/10.1021/jacs.7b00648.
Largy, E.; Cantais, F.; Van Vyncht, G.; Beck, A.; Delobel, A. Orthogonal Liquid Chromatography–Mass Spectrometry Methods for the Comprehensive Characterization of Therapeutic Glycoproteins, from Released Glycans to Intact Protein Level. Journal of Chromatography A 2017, 1498, 128–146. https://doi.org/10.1016/j.chroma.2017.02.072.
Largy, E.; Marchand, A.; Amrane, S.; Gabelica, V.; Mergny, J.-L. Quadruplex Turncoats: Cation-Dependent Folding and Stability of Quadruplex-Dna Double Switches. Journal of the American Chemical Society 2016, 138 (8), 2780–2792. https://doi.org/10.1021/jacs.5b13130.
Largy, E.; Mergny, J.-L. Shape Matters: Size-Exclusion HPLC for the Study of Nucleic Acid Structural Polymorphism. Nucleic acids research 2014, 42 (19), e149. https://doi.org/10.1093/nar/gku751.
Largy, E.; Liu, W.; Hasan, A.; Perrin, D. M. A Pyrimidopyrimidine Janus-AT Nucleoside with Improved Base-Pairing Properties to Both A and T within a DNA Duplex: The Stabilizing Effect of a Second Endocyclic Ring Nitrogen. Chemistry - A European Journal 2014, 20 (6), 1495–1499. https://doi.org/10.1002/chem.201303867.
Largy, E.; Liu, W.; Hasan, A.; Perrin, D. M. Base-Pairing Behavior of a Carbocyclic Janus-AT Nucleoside Analogue Capable of Recognizing A and T within a DNA Duplex. Chembiochem 2013, 14 (16), 2199–2208. https://doi.org/10.1002/cbic.201300250.
Xie, X.; Choi, B.; Largy, E.; Guillot, R.; Granzhan, A.; Teulade-Fichou, M.-P. Asymmetric Distyrylpyridinium Dyes as Red-Emitting Fluorescent Probes for Quadruplex DNA. Chemistry - A European Journal 2013, 19, 1214–1226. https://doi.org/10.1002/chem.201203710.
Largy, E.; Granzhan, A.; Hamon, F.; Verga, D.; Teulade-Fichou, M.-P. Visualizing the Quadruplex: From Fluorescent Ligands to Light-up Probes. Topics in current chemistry 2013, 330, 111–177. https://doi.org/10.1007/128_2012_346.
Petenzi, M.; Verga, D.; Largy, E.; Hamon, F.; Doria, F.; Teulade-Fichou, M.-P.; Guédin, A.; Mergny, J.-L.; Mella, M.; Freccero, M. Cationic Pentaheteroaryls as Selective G-Quadruplex Ligands by Solvent-Free Microwave-Assisted Synthesis. Chemistry - A European Journal 2012, 18 (45), 14487–14496. https://doi.org/10.1002/chem.201202097.
Sidibe, A.; Hamon, F.; Largy, E.; Gomez, D.; Teulade-Fichou, M.-P.; Trentesaux, C.; Riou, J.-F. Effects of a Halogenated G-Quadruplex Ligand from the Pyridine Dicarboxamide Series on the Terminal Sequence of XpYp Telomere in HT1080 Cells. Biochimie 2012, 94 (12), 1–10. https://doi.org/10.1016/j.biochi.2012.07.003.
Largy, E. Hamon, F.; Teulade-Fichou, M.-P. A Streptavidin Paramagnetic-Particle Based Competition Assay for the Evaluation of the Optical Selectivity of Quadruplex Nucleic Acid Fluorescent Probes. Methods 2012, 57 (1), 129–137. https://doi.org/10.1016/j.ymeth.2012.02.008.
Largy, E.; Saettel, N.; Hamon, F.; Dubruille, S.; Teulade-Fichou, M.-P. Screening of a Chemical Library by HT-G4-FID for Discovery of Selective G-Quadruplex Binders. CPD 2012, 18 (14), 1992–2001. https://doi.org/10.2174/138161212799958350.
Largy, E.; Hamon, F.; Rosu, F.; Gabelica, V.; Pauw, E. D.; Guédin, A.; Mergny, J.-L.; Teulade-Fichou, M.-P. Tridentate N-Donor Palladium(II) Complexes as Efficient Coordinating Quadruplex DNA Binders. Chemistry - A European Journal 2011, 17 (47), 13274–13283. https://doi.org/10.1002/chem.201102300.
Hamon, F.; Largy, E.; Guédin-Beaurepaire, A.; Rouchon-Dagois, M.; Sidibe, A.; Monchaud, D.; Mergny, J.-L.; Riou, J.-F.; Nguyen, C.-H.; Teulade-Fichou, M.-P. An Acyclic Oligoheteroaryle That Discriminates Strongly between Diverse G-Quadruplex Topologies. Angewandte Chemie (International ed. in English) 2011, 50 (37), 8745–8749. https://doi.org/10.1002/anie.201103422.
Tran, P. L.; Largy, E.; Hamon, F.; Teulade-Fichou, M.-P.; Mergny, J.-L. Fluorescence Intercalator Displacement Assay for Screening G4 Ligands towards a Variety of G-Quadruplex Structures. Biochimie 2011, 93 (8), 1288–1296. https://doi.org/10.1016/j.biochi.2011.05.011.
Renaud de la Faverie, A.; Hamon, F.; Primo, C. D.; Largy, E.; Dausse, E.; Delaurière, L.; Landras-Guetta, C.; Toulmé, J.; Teulade-Fichou, M.-P.; Mergny, J. Nucleic Acids Targeted to Drugs: SELEX against a Quadruplex Ligand. Biochimie 2011, 93 (8), 1357–1367. https://doi.org/10.1016/j.biochi.2011.05.022.
Largy, E.; Hamon, F.; Teulade-Fichou, M.-P. Development of a High-Throughput G4-FID Assay for Screening and Evaluation of Small Molecules Binding Quadruplex Nucleic Acid Structures. Analytical and Bioanalytical Chemistry 2011, 400 (10), 3419–3427. https://doi.org/10.1007/s00216-011-5018-z.
Halder, K.; Largy, E.; Benzler, M.; Teulade-Fichou, M.-P.; Hartig, J. S. Efficient Suppression of Gene Expression by Targeting 5’-UTR-Based RNA Quadruplexes with Bisquinolinium Compounds. Chembiochem 2011, 12 (11), 1663–1668. https://doi.org/10.1002/cbic.201100228.
Piazza, A. A.; Boule, J.-B.; Lopes, J.; Mingo, K.; Largy, E.; Teulade-Fichou, M.-P.; Nicolas, A.; Boulé, J.-B. Genetic Instability Triggered by G-Quadruplex Interacting Phen-DC Compounds in Saccharomyces Cerevisiae. Nucleic Acids Research 2010, 38 (13), 4337–4348. https://doi.org/10.1093/nar/gkq136.
Granzhan, A.; Largy, E.; Saettel, N.; Teulade-Fichou, M.-P. Macrocyclic DNA-Mismatch-Binding Ligands: Structural Determinants of Selectivity. Chemistry - A European Journal 2010, 16 (3), 878–889. https://doi.org/10.1002/chem.200901989.
Chapitres de livre
Largy, E.. Application of HDX to oligonucleotides for increased characterization capabilities. In Oligonucleotide Therapeutics Characterization by Mass Spectrometry; Lippens, J.L., Jora, M., Eds.; Royal Society of Chemistry: Cambridge; to be published in 2026.
Largy, E.; Mergny, J.-L.; Gabelica, V. Role of Alkali Metal Ions in G-Quadruplex Nucleic Acid Structure and Stability. In The Alkali Metal Ions: Their Role for Life; Sigel, A., Sigel, H., Sigel, R. K. O., Eds.; Metal Ions in Life Sciences; Springer International Publishing: Cham, 2016; Vol. 16, pp 203–258. https://doi.org/10.1007/978-3-319-21756-7_7.
Largy, E.; Teulade-Fichou, M.-P. Screening for Quadruplex Binding Ligands: A Game of Chance? In Guanine Quartets; Spindler, L., Fritzsche, W., Eds.; Royal Society of Chemistry: Cambridge, 2012; pp 248–262. https://doi.org/10.1039/9781849736954-00248.
Conférences académiques
Proceedings
Amrane, S.; Bedrat, A.; Renaud De La Faverie, A.; Zhou, J.; Mendoza, O.; De Rache, A.; Guedin, A.; Largy, E.; Amor, S.; Salgado, G.; Bourdoncle, A.; Yatsunyk, L. A.; Mergny, J.-L. Quadruplexes Are Everywhere! In Collection Symposium Series; Institute of Organic Chemistry and Biochemistry, Academy of Sciences of the Czech Republic: Český Krumlov, 2014; pp 62–65. https://doi.org/10.1135/css201414062.
Granzhan, A.; Saettel, N.; Hamon, F.; Largy, E.; Guetta, C.; Teulade-Fichou, M.-P. Recognition of DNA Secondary Structures: From Structure to Fluorescent Probes. In Collection Symposium Series; Institute of Organic Chemistry and Biochemistry, Academy of Sciences of the Czech Republic: Český Krumlov, 2011; pp 77–85. https://doi.org/10.1135/css201112077.
Communications orales
Largy, E., Dynamics and biophysics of aptamer complexes, Bordeaux Aptamer Mini-Symposium. 15 octobre 2025, Bordeaux
Largy, E., Caractérisation biophysique des oligonucléotides : stabilité, structure, dynamique et interactions. Journée Club AFSEP Sud Ouest : Analyse des produits biopharmaceutiques : défis, innovations et perspectives. 12 juin 2025, Invité, Toulouse
Largy, E., Hydrogen-Deuterium Exchange and Native Mass Spectrometry to characterize G4 conformations and dynamics. INTERACTION WINS 2024 Winter School, 20 février 2024, Invité, en ligne
Largy, E., Ranz, M., Guisiano, R., Gabelica, V., Hydrogen-deuterium exchange native mass spectrometry of G-quadruplex DNA. International Mass Spectrometry Conference (IMSC), 27 août 2022, Maastricht (Pays-Bas)
Largy, E., Gabelica, V., HDX/Native MS of G4s. G4thering - 8th International Meeting on Quadruplex Nucleic Acids, 27 juin 2022, Marienbad (République Tchèque)
Largy, E., Gabelica, V., Biophysical characterization of G-quadruplex nucleic acids by Hydrogen-Deuterium exhange coupled to native mass spectrometry. HDXMS2022 conference, 26 avril 2022, Londres (Royaume-Uni)
Largy, E., Gabelica, V., Native HDX/MS of DNA Oligonucleotides. 5th Online Seminar in HDX-MS: Nontraditional HDX-MS, 7 octobre 2021, Invité, en ligne.
Largy, E., Gabelica, V., Native Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry of Structured DNA Oligonucleotides. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse, 15 juin 2021, en ligne.
Largy, E., Gabelica, V., Native Hydrogen Deuterium Exchange Mass Spectrometry of G-quadruplexes. Nucleic acid secondary structures: G4s and beyond, 10 décembre 2020, en ligne.
Largy, E., Gabelica, V., Native Hydrogen Deuterium Exchange Mass Spectrometry of Oligonucleotides. Orbitrap User Meeting, 3 décembre 2019, Invité, Paris (France) (keynote lecture).
Largy, E., Fricot, L., Ferrer, A., Gabelica, V., Native Hydrogen Deuterium Exchange Mass Spectrometry of Oligonucleotides. Journée Scientifique du département STS, 1er octobre 2019, Pessac (France)
Largy, E., Fricot, L., Ferrer, A., Gabelica, V., Nucleic Acids Biophysics by In-Solution HDX/Native MS. 67th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, 2—6 juin 2019, Atlanta, GA (USA)
Largy, E., Haustant, J., Rosu, F., Mesmin, C., Gabelica, V., Combining native MS, on-line HDX-MS and IMS to study biomolecule structure and dynamics. 5th Annual European Ion Mobility Seminar, 20 mars 2019, Pessac (France)
Largy, E., Gabelica, V., Continuous-flow hydrogen-deuterium exchange to study quadruplex nucleic acids structures, stability, and interactions. BIONIC 2018, 26—28 septembre 2018, Padova (Italy)
Largy, E., Gabelica, V., Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry (HDX/MS) to study quadruplex nucleic acid folding and interactions. 10th Bordeaux RNA Club, 14-15 juin 2018, Pessac (France)
Largy, E., Gabelica, V., Continuous-flow HDX/MS to study Nucleic acid folding and interactions. 66th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, 3—7 juin 2018, San Diego, CA (USA)
Largy, E., Gabelica, V., Continuous-flow HDX/MS to study Nucleic acid folding and interactions. COST BM1403: Native Mass Spectrometry and Related Methods for Structural Biology, Février 2018, Vienne (Autriche)
Largy, E., Fast, robust and customizable analytical workflows for therapeutic proteins N- and O-glycan profiling by LC/MSE. Waters Glycans meeting, 2016.
Largy, E., Mergny, J. L., Size-exclusion chromatography for the study of nucleic acid structural polymorphism. IECB internal seminar, Mars 2014, Pessac (France)
Largy, E., Mergny, J. L., Development of Size-Exclusion HPLC (SE-HPLC) for the Study of Quadruplex Nucleic Acid Polymorphism. 4th GDR G4 day, Mars 2014, Grenoble (France)
Largy, E., Hamon, F., Guédin, A, Mergny, J.-L., Teulade-Fichou, M.-P. Non-canonical binders of quadruplex DNA: groove binding and metallation. 2nd GDR G4 day, Janvier 2012, Pessac (France)
Largy, E., Hamon, F., Guédin, A, Mergny, J.-L., Teulade-Fichou, M.-P. Interaction of new metal complexes with quadruplex DNA. 1st GDR G4 day, Mars 2011, Paris (France)
Largy, E., Hamon, F., Guédin, A, Mergny, J.-L., Teulade-Fichou, M.-P. Synthesis and evaluation of new metal complexes quadruplex DNA ligand. 14ème Journée de Chimie Organique et Chimie Organique Biologique de la Montagne-Sainte-Geneviève, Juin 2010, Paris (France)
Posters
Largy, E., Mackereth, C., GPU-accelerated Amber molecular dynamics for the study of DNA aptamer structures. JCAD 2024, 4-6 Novembre 2024, Bordeaux
Largy, E., Ranz, M., Gabelica, V., Mackereth, C., Hydrogen Deuterium Exchange coupled to Native Mass Spectrometry (HDX/MS) to study telomeric G quadruplex DNA structures. 18th NMR Retreat of Protein-RNA Interactions, 21-25 janvier 2024, Parpan (Suisse)
Largy, E., Gabelica, V., OligoR: An online software suite for oligonucleotide HDX/MS and quantitative native MS data treatment and visualization, 68th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, 1—5 juin 2020, en ligne.
Khristenko, N., Largy, E., Haustant J., Rosu F., Mesmin C., Gabelica V. Characterizing the folding of recombinant therapeutic proteins by H/D exchange, native mass spectrometry and ion mobility spectrometry, 68th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, 1—5 juin 2020, en ligne.
Largy, E., Gabelica, V., Native HDX/MS of G-quadruplex oligonucleotides, ANNA 2019 - Advances in Noncanonical Nucleic Acids, 1—5 juin 2019, Rogaška Slatina, Slovénie.
Largy, E., Delobel, A., Epitope mapping of an interleukin receptor for three therapeutic antibodies by HDX-MS. Analytical Technologies Europe, 6—9 Mars 2018, Barcelone, Espagne.
Largy, E., Cantais, F., Delobel, A., Orthogonal Liquid Chromatography-Mass Spectrometry Methods for the Comprehensive Characterization of Therapeutic Glycoproteins, from Released Glycans to Intact Protein Level. Analytical Technologies Europe, 6—9 Mars 2018, Barcelone, Espagne.
Largy, E., Cantais, F., Delobel, A., State-of-the art LC/MS Methods Applied to the Characterization of a Highly-glycosylated Fusion Protein: Etanercept. Analytical Technologies Europe, 14—17 Mars 2017, Bruxelles, Belgique.
Largy, E., Catrain, A., Delobel, A., Multi-level Mass Spectrometric Characterisation of Antibody-Drug Conjugates in a Regulated Environment. Analytical Technologies Europe, 14—17 Mars 2017, Bruxelles, Belgique.
Largy, E., Catrain, A., Delobel, A., Multi-level Mass Spectrometric Characterisation of Antibody-Drug Conjugates in a Regulated Environment. Analytical Technologies Europe, 14—17 Mars 2017, Bruxelles, Belgique.
Largy, E., Catrain, A., Van Vyncht, G., Delobel, A., Development and use of 2D-LC/MS as a versatile and powerful tool for the analysis of mAbs and ADCs in a regulated environment. Analytical Technologies Europe, 15—18 Mars 2016, Vienne, Autriche.
Hosfield, C., Largy, E., Catrain, A., Cantais, F., Van Vyncht, G., Rosenblatt, M., Saveliev, S., Uhr, M., Delobel, A., Characterizing Deamidation and Oxidation in Adalimumab with Low pH Peptide Mapping and Middle-Up Mass Spec Analysis. 64th ASMS Sanibel, 5—9 Juin 2016, San Antonio, TX, USA.
Largy, E., Hamon, F., Teulade-Fichou, M.P. A High throughput G4-FID assay for screening and evaluation of quadruplex ligands, Fourth International Meeting on Quadruplex nucleic acids, 2013, Singapour
Largy, E., Hamon, F., Guedin, A., Mergny, J., Rosu, F., Gabelica, V., Bombard, S., Teulade-Fichou, M. New metal terpyridine complexes targeting the telomeric G-quadruplex, Third International Meeting on G-Quadruplex and G-assembly, 2011, Sorrento, Italie.
Largy, E., Hamon, F., Teulade-Fichou, M. Development of a high-throughput G4-FID assay for screening and evaluation of quadruplex ligands, Third International Meeting on G-Quadruplex and G-assembly, 2011, Sorrento, Italie.
Largy, E., Hamon, F., Guetta, C., Bertrand, H., Monchaud, D., Guedin, A., Mergny, J., Bombard, S., Teulade-Fichou, M. New metal terpyridine complexes targeting the telomeric G-quadruplex, Pacifichem 2010, International Chemical Congress of Pacific Basin Societies, 2010, Honolulu, HI, USA.
Largy, E., Piazza, A., Boule, J. B., Lopez, J., Khristenko, N., Lacroix, L., Teulade-Fichou, M., Nicolas, A. High affinity G-quadruplex binders Phen-DC compounds trigger genetic instability in yeast, Pacifichem 2010, International Chemical Congress of Pacific Basin Societies, 2010, Honolulu, HI, USA.
Largy, E., Hamon, F., Guedin, A., Mergny, J.-L., Teulade-Fichou, M.P. Synthèse de nouveaux ligands organométalliques de l’ADN quadruplexe, Journée de l’Ecole Doctorale de Chimie de PARIS SUD, 2010.
Largy, E., Teulade-Fichou, M. Synthèse de ligands fluorescents de l’ADN quadruplexe – Méthode d’évaluation haut débit de l’affinité d’un ligand pour diverses structures d’ADN/ARN quadruplexes, Journée de l’Ecole Doctorale de Chimie de PARIS SUD, 2009
Organisation
5th international Meeting on Quadruplex nucleic acids, G4thering in Bordeaux: Chemistry, biology, and nanotechnology, 26—28 Mai 2015, IECB, Pessac, France
1st GDR G4 day, Structures et Rôles Biologiques des Quadruplexes d’Acides Nucléiques, Quadruplex Research Group (GDR 3431), 30 Mars 2011, Institut Curie, Paris, France
Communications industrielles
Articles
Cajot, C., Delobel, A., Largy, E., Epitope Mapping of an Interleukin Receptor for Three Therapeutic Antibodies by Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry, LCGC, 2018, 16, 8—14.
Largy, E., Catrain, A., Van Vyncht G., Delobel, A. 2D-LC–MS for the Analysis of Monoclonal Antibodies and Antibody–Drug Conjugates in a Regulated Environment, LCGC, 2016, 14, 2935.
Webinar
- Largy, E., Mass spectrometry toolkit for the characterisation of protein glycosylation, 2016.
Notes d’application
Largy, E., Delobel, A., Stress testing of Humira (adalimumab) monitored by Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry (HDX-MS), Quality Assistance (Donstienne, Belgique) 2017.
Largy, E., Cajot C., Delobel, A., Epitope mapping of an interleukin receptor for three therapeutic antibodies by Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry (HDX-MS), Quality Assistance (Donstienne, Belgique) 2017.
Dusserre-Bresson, F., Largy, E., Lepers C., Mantini, C., Plennevaux, C., Vandermeers, F. Delobel, A., Analytical approaches for the evaluation of ADCC activity of mAbs, Quality Assistance (Donstienne, Belgique) 2017.
Largy, E., Cantais, F., Van Vyncht, G., Delobel, A., Characterisation of the glycosylation of Humira® (Adalimumab) and Erbitux®(Cetuximab) by high resolution mass spectrometry, Quality Assistance (Donstienne, Belgique) 2016.
Largy, E., Cantais, F., Van Vyncht, G., Delobel, A., Characterisation of the glycosylation of Enbrel® (Etanercept) by high resolution mass spectrometry, Quality Assistance (Donstienne, Belgique) 2016.
Largy, E., Catrain, A., Van Vyncht, G., Delobel, A., Characterisation of Antibody-Drug Conjugates by High-Resolution Mass Spectrometry, Quality Assistance (Donstienne, Belgique) 2015.
Largy, E., Catrain, A., Van Vyncht, G., Delobel, A., Characterisation of Humira® (Adalimumab) by High-Resolution Mass Spectrometry, Quality Assistance (Donstienne, Belgique) 2015.